RAS-MIKROBIOM: Verktøyet til DNA-sekvensering for RAS-anlegg

Offentlig prosjektsammendrag

Resirkulerende akvakultursystemer (RAS) er en bærekraftig metode for fiskeoppdrett. Driftsutfordringen ligger i stor grad å håndtere vannkvaliteten. Der fôr og avføring fra fisk akkumuleres i vannet og gir grobunn for et yrende liv av bakterier og virus. Kjernen i et RAS-anlegg er biofilteret, der skadelig ammoniakk omdannes til mindre giftig nitritt og nitrat gjennom mikrobiell aktivitet (nitrifisering). Denne mikrobielle prosessen involverer ulike organismer som konkurrerer om vannets næringsstoffer. Hurtigvoksende heterotrofe bakterier utkonkurrerer ofte de saktevoksende nitrifiserende bakteriene. Balansen og sammensetningen av disse bakteriene endres avhengig av faktorer som vannkvalitet, organisk materiale og oksygennivå. En fersk studie viste at bare 12 % av mikrobene på biofilmbærere i RAS-biofiltre var nitrifiserende bakterier, noe som reiser spørsmål om funksjonen til de resterende 88 %. Dette kunnskapshullet fremmer bruk av DNA-sekvensering for å forstå det mikrobielle samfunnet i RAS. Searas samarbeider med Leirvik AS og Bremnes Seashore AS om å bygge et nytt RAS-anlegg i Skålevik, der første innsett av fisk vil være i september 2023, med et nytt innsett i april 2024. Prosjektet tar sikte på å følge mikrobiomets utvikling under begge utsettingene ved hjelp av hyppig DNA-sekvensering av RAS-prøver og kontinuerlig innsamling av vannkvalitetsdata. Disse dataene vil bli analysert for å identifisere potensielle sammenhenger mellom vannkvalitet og mikrobiomet. Det er verdt å merke seg at ingen tidligere forskning har undersøkt mikrobiomets tidsbaserte variasjon i et RAS-anlegg, noe som gjør dette prosjektet viktig for bransjen. I tillegg vil prosjektet undersøke hvordan innsikt i anleggets mikrobiom kan forbedre driftsstyringen.