Breeding for better cardiovascular and respiratory function of pigs “A heart for pigs”

Offentlig prosjektsammendrag

I dette prosjektet skal vi utvikle nye relevante egenskaper som karakteriserer grisens respirasjon og sirkulasjonsegenskaper. Pr i dag eksisterer ikke måleprotokoller for disse egenskapene som er enkle/relevante nok for å kunne ta i bruk i et avlsprogram. Tradisjonelle metoder for feks. detaljert avbilding av hjertet med CT krever bruk av kontrastvæske, og dette er ikke ønskelig å bruke i avlsprogrammet, siden kontrastvæska gjør det vanskelig å utnytta scanna gris til mat, senere. For å komme fram til nye relevante mål, kreves det bedre kunnskap om utviklinga av hjertet og lungene til grisen igjennom tilvekstperioden. Dette skal vi få til gjennomen longitudinell studie på SEARCH, der vi scanner grisen på ulike vektstadier fra 30-130 kg med en avansert 4D CT-scanner. Vi ønsker så å utvikle maskinlæringsmodeller for å kunne overføre segmenteringer fra bilder, tatt med en avansert CT-protokoll med bruk av kontrastvæske, til en enklere protokoll (uten bruk av kontrastvæske) som er mulig å benytte i avlsprogammet. Vi vil videre anvende disse modellene på bilder fra en forbedret CT-protokoll (der vi også anvender EKG-trigging) i avlsprogrammet, og vi ønsker derifra å kunne beregne relevante egenskaper som kvantifiserer hjerte og lungekapastieten (feks hjertets slagvolum) på mange individer. Disse egenskapene ønsker vi i etterkant å koble opp mot helseegenskaper fra felt (feks dødelighetsdata fra felt) gjennom bruk av genotypedata for å finne ut om det er mulig å bruke sirkulasjon- og respirasjonsdata fra CT til å kunne avle på forbedret svinehelse i internasjonale produksjonssystemer.