Presisjonavl

Offentlig prosjektsammendrag

AquaGen er et selskap som leverer rogn til oppdretter av laks, ørret og rognkjeks i Norge og internasjonalt. Vi driver avlsprogrammer på samtlige arter, for å kunne tilby kundene individer som er rasktvoksende og friske. AquaGen har ledet an i bruken av bioteknologi i avl, og i løpet av de siste 20 år er særlig genomikk/molekylærgenetikk blitt en viktig komponent i bedriftens virksomhet. AquaGen innførte DNA-testing i avlsprogrammet allerede for 15 år siden, i og med innføringen av markør-basert seleksjon for økt resistens mot virussykdommen IPN. Den gang kunne datamengden håndteres med relativt enkle virkemidler; noen tusen dyr ble genotypert ("DNA-avlest") for noen hundre DNA-markører, og selve analysen kunne gjøres ved hjelp av Microsoft Excel. Siden den gang har feltet genomikk hatt en rivende utvikling, og mulighetsrommet har utvidet seg mye. I dag anvendes mikromatriser med ti-/hundretalls tusen DNA-markører rutinemessig på mange titalls tusen dyr i året, og helgenomsekvensering brukes for å kartlegge den totale DNA-variasjonen i utvalgte, sentrale dyr i avlspopulasjonene. Ulike typer "-omics"-data må av og til inkorporeres, og fremtiden forventes å bringe nye former for komplekse genotype- og fenotypedata. Dette prosjektet inneholder ulike arbeidspakker som har det til felles at de alle vil bidra til mer effektiv, regnemessig smart, systematisk og fullstendig bruk av stordata, med det formål å hente ut nye sammenhenger i dataene, til bruk i og til nytte for AquaGens avlsprogram og rognproduksjon.