Enzymer for cellelysis og frigjøring av nukleinsyrer

Offentlig prosjektsammendrag

Alle celler inneholder sitt unike arvestoff (DNA og RNA), og ved å analysere det kan man påvise sykdom og lære om normal utvikling i alle organsimer. Det finnes et utall av metoder for å diagnostisere og forske på arvemateriale, og dette arbeidsfeltet har hatt en rivende utvikling de siste tiårene. Alle tegn tyder på at denne type analyser bare vil vokse i fremtiden. Selv om metodene er forskjellige, har de alle et felles krav. For å kunne analyseres, må man først få tak i arvestoffet i en mengde og renhet som tillater analyse. Tidligere har det vært vanlig å rense opp DNA/RNA fra en prøve i et eget trinn, før det blir analysert videre. Ettersom nye metoder lar en analysere mindre og mindre arvestoff mens kravene til hvor raskt prøvesvar ønskes, ønskes dette separate rensetrinnet fjernet. Istedet vil man analysere mer eller mindre direkte i prøveamterialet. I dette prosjektet vil ArcticZymes se på nye metoder for å frigjøre DNA og RNA fra celler slik at det kan analyseres direkte. Det er flere konsepter som vil bli undersøkt. -Selskapet har allerede lansert en proteinase som er lettere å inaktivere enn konkurrentene. Denne har vist seg å kunne endre kromatin til nakent DNA, samtidig som man ikke må fjerne proteinasen før enzymer tilsettes. Her ønsker vi å se om dette også er tilfelle for RNA analyser. I tillegg kan proteinasen brukes for å åpne opp virus før analyse. -Enkelte bakterier og sopp kan være svært vanskelige og åpne for å få ut DNA/RNA. Vi vil her se på en helt ny metode for å få til dette. -Dersom man vil sekvensere alt patogent DNA i en prøve fra mennesker er det en fordel å først fjerne det humane DNA. Her vil vi se på nye metoder å gjøre dette på. Disse nye måtene å åpne celler på gir oss muligheten til å kombinere forbehandling av biologiske prøver med allerede eksisterende produkter vi har innen diagnostikk. Slik tar vi sikte på også å øke vår andel i en verdikjede fra prøvetaking til prøvesvar.