CMS-test

Offentlig prosjektsammendrag

Kardiomyopatisyndrom (CMS) er en virussykdom som forårsaker store tap i norsk lakseoppdrett, hovedsaklig på stor fisk og sent i produksjonsløpet. CMS forårsakes av piscint myokardittvirus (PMCV). AquaGen bruker såkalt markør-assistert seleksjon (MAS) til å øke laksens resistens mot CMS. En betydelig del av laksens genetisk betingede variasjon i CMS-resistens bestemmes av ett enkelt gen; MAS innebærer at avls- og produksjonskandidater DNA-testes for å finne de individene som bærer den gunstige varianten av dette genet. AquaGen identifiserte sine opprinnelige DNA-markører for CMS-resistens utifra data fra et feltutbrudd, hvor den observerte fenotypen var konsentrasjon av PMCV. I senere tid er en reproduserbar smittemodell blitt utviklet hos VESO Vikan. Vi ønsker å benytte VESO sin smittemodell til å 1) forbedre vårt eksisterende seleksjonsverktøy (finne bedre genmarkører slik at seleksjonen blir mer presis), 2) forstå bedre de biologiske endringene som skjer når vi selektere for økt resistens, 3) gå fra MAS til genomisk seleksjon (GS); en beslektet metode hvor seleksjonen skjer på grunnlag av DNA-markører spredt utover hele genomet snarere enn bare innenfor et lite genoområde. GS har et større potensiale for hurtig, kontinuerlig genetisk framgang enn MAS har. Vi ønsker også å avdekke den nøyaktige identiteten til "CMS-genet" ved hjelp av nestegenerasjons sekvensering.