Resistance against IPN in Rainbow trout

Offentlig prosjektsammendrag

Sykdommer er et problem i oppdrett av regnbueørret og gir dødelighet, redusert tilvekst og økonomiske tap med negativ effekt på fiskevelferd og miljø. Avl for en fisk med større motstandskraft mot spesifikke sykdommer basert på smittetester utnytter bare halvparten av den genetiske variasjonen. Genomisk seleksjon gjør det mulig å selektere de beste fiskene fra de beste familiene noe som både gir økt sikkerhet og seleksjonsintensitet og derfor større genetisk framgang per generasjon. En forutsetning for genomisk seleksjon er at vi kjenner DNA-base rekkefølgen for et representativt utvalg av dyr for den aktuelle arten. For regnbueørret finnes et slikt referanse genom. I tillegg må vi ha gode fenotyper for de egenskapene vi ønsker å gjøre utvalg for. Målet med prosjektet er å finne genetiske markører (QTL) for motstandskraft mot IPN hos regnbueørret hos Osland Stamfisk, og undersøke hvordan denne informasjonen kan brukes til å øke fiskens motstandskraft mot IPN. Våren 2018 vil vi gjennomføre en smittetest av startfôringsklar yngel (3750 avkom etter 75 hannfisk og 150 hofisk) hvor vi vil registrere død fisk, dato død og ta ut en vevsprøve fra hver død og overlevende fisk. Vevsprøvene vil bli genotypet med en 50K SNP-array for å kunne spore hver fisk til sine foreldre og til å lage en genomisk slektskapsmatrise mellom fiskene, noe som gjør det mulig å estimere genetisk variasjon og å finne QTL for motstandskraft mot IPN. En evaluering av QTL funn vil bli gjort basert på data fra en smittetest våren 2021 av avkom etter noen selekterte søsken av de fiskene som vil bli smittetestet våren 2018, og basert på tilsvarende data fra døde og overlevende fisk med påvist IPN i en felttest. Prosjektet vil gi kunnskap som er nødvendig for å kunne gjøre et effektivt utvalg for større motstandskraft mot IPN hos regnbueørret, og slik gjøre Osland Stamfisk bedre i stand til å levere et genetisk sett bedre regnbueørret materiale til sine kunder.